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Köln

Medizin und Gesundheitswesen

Adresse:
ZB MED – Informationszentrum Lebenswissenschaften
Gleueler Straße 60
50931 Köln

Bonn

Ernährungs-, Umwelt- und Agrarwissenschaften

Adresse:
ZB MED – Informationszentrum Lebenswissenschaften
Friedrich-Hirzebruch-Allee 4
53115 Bonn

InfoCenter

INFORMATION.

WISSEN.
LEBEN.

Infrastruktur- und Forschungszentrum für lebenswissenschaftliche Daten und Informationen.

Programmieren und Datenkompetenz

Praxisnahe Workshops, mit denen Sie Forschungsdaten effizient, nachvollziehbar und offen bearbeiten.

Wer mit Daten arbeitet, spart mit ein paar Grundlagen im Programmieren viel Zeit und macht die eigenen Ergebnisse nachvollziehbar. ZB MED bietet dafür seit 2018 Workshops an, die sich ausdrücklich auch an Einsteiger:innen ohne IT-Vorkenntnisse richten.

Für wen?

Medizin und Gesundheitswissenschaften: Unser Schwerpunkt sind Forschende, Promovierende und Studierende in der Medizin, den Gesundheitswissenschaften und der biomedizinischen Grundlagenforschung, insbesondere an den Hochschulen in NRW. Für diese Zielgruppen bauen wir unser Angebot gezielt aus. Studierende der Medizin können sich hier für unsere geplanten Workshops vormerken.

Bibliotheken und Infrastruktureinrichtungen: Außerdem schulen wir Beschäftigte in wissenschaftlichen und öffentlichen Bibliotheken sowie in Forschungs- und Infrastruktureinrichtungen.

Einrichtungen können die Workshops für ihre Mitarbeitenden buchen. Die meisten finden online statt, Präsenzformate sind auf Anfrage möglich.

Unsere Themen

Programmieren und Automatisieren

  • Unix Shell und GNU/Linux: Dateien und Arbeitsabläufe über die Kommandozeile steuern
  • Python: von den Grundlagen über die Datenanalyse mit Pandas bis zur Visualisierung, mit Aufbaukurs und Einstieg in maschinelles Lernen
  • Git, GitLab und Codeberg: Versionen der eigenen Arbeit verwalten und gemeinsam an Projekten arbeiten

Forschungsdaten

  • Tidy Data und OpenRefine: Tabellen sauber strukturieren und bereinigen
  • SQL: Daten in relationalen Datenbanken abfragen
  • Wikidata und Linked Open Data: Wissen strukturiert erfassen und mit SPARQL abfragen
  • FAIR Data & Software, Open Science und der Forschungskreislauf

Neue Themen

  • Arbeiten mit lokalen Sprachmodellen (LLMs)
  • Offene Lehrmaterialien (OER) mit freier Software erstellen

Die Formate reichen von halbtägigen Modulen bis zu zweitägigen Workshops. Einzelne Themen lassen sich auch zu individuellen Formaten kombinieren.

Unser Ansatz: The Carpentries

Viele unserer Workshops basieren auf den Lehrmaterialien und der Didaktik von The Carpentries. Das ist eine internationale Non-Profit-Community, die offen lizenzierte Workshops zu Daten- und Programmierkompetenzen entwickelt:

  • Library Carpentry für Bibliotheken und Informationseinrichtungen
  • Software Carpentry für das Programmieren in der Forschung
  • Data Carpentry für die Auswertung und Visualisierung von Forschungsdaten

Typisch für den Carpentries-Ansatz ist Live-Coding: Die Lehrenden programmieren Schritt für Schritt vor, und die Teilnehmenden machen am eigenen Rechner direkt mit. Fehler gehören dazu und werden gemeinsam gelöst.

Mehrere Kolleg:innen bei ZB MED sind zertifizierte Carpentries Instructors und Instructor Trainer und engagieren sich in der deutschsprachigen Carpentries-Community. Unser Kernangebot ist der zweitägige Library Carpentry Workshop (Unix Shell, Python, Git) auf Deutsch oder Englisch. Außerdem arbeiten wir an AI Carpentry mit, den neuen Lehrmaterialien der Carpentries zum reflektierten Einsatz von KI in der Forschung.

Workshop anfragen

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