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WISSEN.
LEBEN.

Infrastruktur- und Forschungszentrum für lebenswissenschaftliche Daten und Informationen.

Datenwissenschaften in den Lebenswissenschaften

Forschung im Programmbereich Data Science and Services

Forschung im Programmbereich Data Science and Services

Data Science and Services

Die Gruppe um Prof. Dr. Konrad Förstner entwickelt datenwissenschaftliche Methoden, Infrastrukturen und Informationsdienste für die Lebens­wissen­schaften. Schwerpunkte sind die Analyse von Hochdurchsatz-Sequenzdaten, Text Mining in biomedizinischer Literatur, Knowledge Graphs sowie der verantwortungsvolle Einsatz lokal betriebener Sprachmodelle in der Forschung.

Ein großer Teil der Arbeit findet in der Nationalen Forschungs­daten­infra­struktur (NFDI) statt: Die Gruppe ist an NFDI4Microbiota beteiligt und baut in Base4NFDI die Basisdienste RDMTraining4NFDI und KGI4NFDI mit auf. Mit Workshops und Schulungen zu Data Science, Data Literacy und Forschungs­daten­manage­ment unterstützt sie Forschende, Bibliotheken und Data Stewards dabei, offen, nachvollziehbar und reproduzierbar mit Daten zu arbeiten.

Team

Leitung

  • Prof. Dr. Konrad Förstner (Leitung des Programmbereichs Data Science and Services, ZB MED / TH Köln)

Mitglieder

  • Muhammad Elhossary (Doktorand, ZB MED Köln)
  • Lina Junctorius (Trainingskoordinatorin RDMTraining4NFDI, ZB MED Köln)
  • Dr. Klaus Lippert (Teamleitung LIVIVO, ZB MED Köln)
  • Rabea Müller (Leitung Training, ZB MED Köln)
  • Ziyad Sanaullah (Wissenschaftlicher Mitarbeiter LIVIVO, ZB MED Köln)
  • Dr. Till Sauerwein (Postdoc, ZB MED Köln)
  • Vanessa Scharf (Doktorandin, ZB MED Köln)
  • Cody Strange (Wissenschaftlicher Mitarbeiter LIVIVO, ZB MED Köln)
  • Justine Vandendorpe (Data Steward, Training und NFDI4Microbiota, ZB MED Köln)
  • Mareike Wohltmann (Projektmanagerin RDMTraining4NFDI, ZB MED Köln)
  • Benjamin Wolff (Doktorand, ZB MED Köln)

Frühere Mitglieder Dr. Arindam Halder, Mandela Akinyemi Fasemore, Vivian Monzon, Felix Langer, Elnaz Jajin, Sughra Hakim, Martin Bilko, Silvia Di Giorgio, Dr. Eva Seidlmayer

Projekte (Auswahl)

  • AQUAS (DFG)
  • BioNT (EU)
  • DiASPora (Leibniz-Gemeinschaft): Text Mining zu Wachstumsbedingungen von Bakterien
  • git.nrw (DH NRW): gemeinsame Git-Infrastruktur und Schulungen für Hochschulen in NRW
  • GRADitude: Python-Werkzeug zur Analyse von Grad-seq-Daten
  • KGI4NFDI (Base4NFDI): Basisdienst für den Aufbau und Betrieb von Knowledge Graphs
  • LIVIVO: Suchportal für die Lebenswissenschaften, u. a. Weiterentwicklung des Frontends und Klassifikation mit lokalen Sprachmodellen
  • MAK Collection (DFG): Open-Access-Publikation der MAK- und BAT-Werte zum Arbeitsschutz auf PUBLISSO, gemeinsam mit dem Programmbereich Open Science
  • NFDI4Microbiota (NFDI): Forschungsdateninfrastruktur für die Mikrobiologie
  • PIXLS (DFG)
  • RDMTraining4NFDI (Base4NFDI): NFDI-weiter Basisdienst für Trainings zum Forschungsdatenmanagement
  • sRNARegNet (DFG)
  • ZB MED Knowledge Environment: digitale, vernetzte Wissensbasis von ZB MED, u. a. Grundlage des LIVIVO-Suchindex

Lokale Hochschulen sind enge Kooperationspartner von ZB MED

Deutsches Logo der Universität zu Köln

Die bewährte Partnerschaft von ZB MED mit der Universität zu Köln zeigt sich in Forschung, Lehre und Informationsversorgung. Der Wissenschaftliche Leiter von ZB MED hat zugleich eine Professur an der Medizinischen Fakultät.

Das Land NRW fördert ZB MED

Deutsches Logo des Ministeriums für Kultur und Wissenschaft des Landes Nordrhein-Westfalen.
Deutsches Logo des Ministeriums für Kultur und Wissenschaft des Landes Nordrhein-Westfalen.

ZB MED ist eine gemeinnützige Stiftung des öffentlichen Rechts, die vom Ministerium für Kultur und Wissenschaft des Landes NRW finanziert wird.

Lokale Hochschulen sind enge Kooperationspartner von ZB MED

Deutsches Logo der Universität Bonn

Mit der Rheinischen Friedrich-Wilhelms-Universität arbeitet ZB MED in Forschung und Lehre zusammen - zum Beispiel mit einer gemeinsamen Professur. Der ZB MED-Standort Bonn befindet sich auf dem Campus Poppelsdorf.

ZB MED steht für Open Access

Logo der Open-Access-Informationsplattform

ZB MED setzt sich für einen freien Zugang zu Wissenschaft und Forschung ein – beispielsweise mit dem Publikationsportal PUBLISSO.

Lokale Hochschulen sind enge Kooperationspartner von ZB MED

Im Fokus der Zusammenarbeit mit der TH Köln steht die informations- und datenwissenschaftliche Qualifizierung – unter anderem mit gemeinsamen Professuren.

ZB MED ist Mitglied von DataCite e.V.

DataCite Logo

DataCite ist eine internationale Non-Profit-Vereinigung, die Services und Know How rund um das Management und die Referenzierung von Forschungsdaten bietet.

ZB MED kooperiert mit der Universität Bielefeld

Logo der Universität Bielefeld

Die Einrichtungen haben vereinbart, gemeinsam komplementäre Informationsdienste für die Lebenswissenschaften anzubieten.

ZB MED setzt sich für Chancengleichheit ein

TOTAL E-QUALITY Deutschland e. V. zeichnet ZB MED 2024 bereits zum fünften Mal mit seinem Zertifikat für das Engagement aus. 

ZB MED ist Mitglied der DAFA

Die Deutsche Agrarfoschungsallianz verfolgt das Ziel, die Leistungsfähigkeit, die Transparenz und die internationale Sichtbarkeit der deutschen Agrarforschung zu verbessern. Sie ist ein Gemeinschaftsprojekt der deutschen Agrarforschung.

ZB MED bekennt sich zu den Grundsätzen von Libraries4Future.

Logo von Libraries4Future

Klimaschutz, Nachhaltigkeit, Verantwortung, sozialer Zusammenhalt.